L'ammoniaca (chimicamente abbreviata in NH3) è un prodotto di scarto dei pesci che espellono attraverso le branchie e la loro urina. L'ammoniaca è molto tossica per tutta la vita acquatica e quindi è molto importante mantenere il suo livello a 0.
Se il PH dell'acqua è inferiore a 7 si avrà ammonio (NH4), un po' meno velenoso dell'ammoniaca ma altrettanto pericoloso.
Sara pertanto necessario, sopratutto in acquari di nuovo allestimento, controllare l'efficienza del filtro biologico verificando la presenza di NH3 o NH4.
Per attivare i filtri biologici si dovranno inoculare i batteri nitrificanti, quindi SHG Aktivedrops in acquari d'acqua dolce oppure, SHG Aktivereef in quelli marini.